1946年2月，全部脱离二军分区，1946年6月，蒋介石发动了对解放区的全面进攻，内战爆发，王新和团长李开道率十八团随军南下，转战冀鲁豫。9月，十八团参加了定陶战役，协同十六团等部队歼灭了国民党军整编第三师。10月，又参加了鄄（城）南包围战。十八团和十六团共同担任围攻东西富村敌一个团的任务。十八团由村南突入，与敌展开了激烈的巷战，很快打乱了敌人的防御体系，敌军仓惶逃跑，十八团向敌纵深猛插，将敌榴弹炮营截获，首次缴获美造榴弹炮5门。是年底至翌年初，十八团又参加了巨（野）金（乡）鱼（台）战役。此役胜利结束后，随纵队移驻黄河以北休整。

1947年6月李开道、王新带领部队参加南征， 1947年6月30日夜，晋冀鲁豫野战军一举突破国民党军的黄河防线，发起了鲁西南战役。王新率十八团参加解放曹县的战斗之后，协同兄弟部队攻歼羊山集之敌。在战斗中，十八团担任主攻羊山街的战斗任务，全团指战员英勇顽强，前仆后继，连续攻占敌地堡、房屋，和兄弟部队一起将敌六十六师师部包围歼灭，十八团生俘其师长宋瑞珂。战后二纵首长给十八团记集体大功一次。接着，十八团随主力挺进大别山，开辟敌后根据地。

1948年11月，淮海战役开始，十八团由大别山西麓北渡淮河向息县方向开进，参加了阻击国民党李延年兵团北援的战斗。激战10昼夜，挡住了敌人，为主力部队围歼黄维兵团创造了条件。淮海战役胜利后，1949年1月全军统一编制番号，编为十军二十九师八十七团（李开道、张磊部），王新任二十九师政治部主任。4月，二十九师参加了渡江战役，他协助师长周发田，率三个团组成前方指挥所，从安庆附近强渡长江。过江后，歼敌安徽保安第三旅，又千里追歼逃敌，挺进到浙赣线。8月，二十九师奉命向大西南进军。10月，参加了成都战役。战役结束后，二十九师进驻川南。1950年1月，王新任川南军区内江军分区副政委兼内江地委副书记。在地方党委统一领导下，负责宣教工作和群众工作，抽调军队干部健全地方党政组织和建立地方武装，剿匪反霸，开辟农村工作，恢复和发展生产，担负起战斗队和工作队的双重任务。1951年1月，王新任十五军二十九师副政委，3月，任师政委。参加抗美援朝后，他和师长张显杨率师参加了第五次战役和上甘岭战役，先后经历大小战斗170余次，歼敌17000余人，缴获大批武器、弹药。全师指战员英勇善战，当年的武城县大队基干连后被编为中国人民志愿军十五军二十九师八十七团三营九连。1952年10月，在朝鲜的一次战斗中，涌现出一大批英模人物，该九连战士邱少云身燃烈火，为严守军纪壮烈牺牲，保障了战斗的胜利，被授予特等功臣、一级战斗英雄和“朝鲜民主主义人民共和国英雄”光荣称号，为朝鲜的自由独立和中朝两国人民的友谊做出了贡献。