秦氏祖籍存在多元起源，主要可归纳为以下四点：
嬴姓起源（主流分支）
以秦始皇嬴政为始祖，其先祖为黄帝后裔，因辅佐大禹治水有功，被舜赐姓嬴氏。这一支系为秦姓最主要的来源，郡望在太原郡。
姬姓起源（正统分支）
周文王姬姓后代鲁国侯伯禽裔孙中，有一支因食邑于秦邑（今河南范县旧城或山东济宁）而形成秦姓，被多部史书记载为“正宗”来源，郡望亦在太原郡。
少数民族融合（多元起源）
包括匈奴、羯、氐等少数民族汉化后形成的秦姓，但具体起源地未明确记载。
